CGIがどうなってるか分からないけど、

逆順で読み込みをすればいいんじゃないでしょうか。

PHPだったら

$lines = file("ログ.txt");

for ($i = count($lines) - 1; $i >= 0; $i--) {

...

}

て感じですか。

日曜プログラマなので自信はないですが…。